Sistema enzimático de una gran complejidad que con su intervención une los dos radicales activados por la proteína transportadora de acilo, uno de dos átomos de carbono (el acetil S-ACP), y uno de tres ástomos de carbono (el malonil-S-ACP). Con la intervención de este sistema enzimático recuperamos una molécula de la proteína transportadora de acilo, se produce la descarboxilación y formamos el acetoacetil S-ACP.
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